于2015年10月18日试运行的安亭新院，是国内先进的研究型医院，在保持现有特色学科的基础上，建设内科等支撑学科，发展其他外科和专科，是一所设计理念先进、功能布局科学、医疗技术领先的三级甲等现代化综合性医院。作为第二军医大学实现“一体两翼”战略布局的“先锋队”，医院汇聚了以长海医院急诊科主任何建、骨科教授康一凡、长征医院心内科教授赵学为代表的近30名各学科领军人物倾情加盟，给肝胆外科以强有力的支撑。医院拥有上海首台第五代射波刀系统等国际一线品牌的大型检查检验设备，30间手术室全部为空气净化手术室，是国内一次性建成手术室最多的单体建筑。